首先，依法行政的首要问题是如何界定政府与市场、政府与社会之间的关系。随着经济和社会的发展，传统的管理模式已经难以适应新的形势需求，这就需要通过法律手段明确各方职责边界，避免越权或缺位现象的发生。例如，在市场监管领域，既要防止过度干预导致企业活力受限，又要有效打击违法行为维护市场秩序。
其次，依法行政的根本问题在于建立健全科学合理的法律法规体系，并保证其得到有效执行。这包括但不限于制定和完善相关法律制度，加强执法队伍建设，提高执法人员素质，以及完善监督机制等方面。只有这样，才能真正实现依法治国方略下对公共权力的有效制约与规范。
总之，“依法行政”的核心在于坚持党的领导、人民当家作主和依法治国有机统一起来，在实践中不断探索符合中国国情和发展阶段特点的路径方法，努力构建起一个公开透明、高效廉洁的服务型政府形象。
