ITS1位于5.8S rRNA基因和18S rRNA基因之间，而ITS4则位于5.8S rRNA基因和28S rRNA基因之间。在PCR扩增过程中，上游引物通常是指从模板DNA的5'端开始合成的引物。
因此，在标准的ITS PCR反应中，ITS1被认为是上游引物。这是因为它靠近目标序列的起始点，能够有效地启动DNA链的延伸过程。
请注意，在实际应用时，具体使用哪个引物作为上游可能取决于实验设计和研究目的。不同的实验室可能会根据自己的需求调整引物的选择。此外，确保引物的质量和特异性对于获得准确可靠的实验结果至关重要。
