复旦大学上海医学院作为国内知名的医学类高校之一，其研究生教育在医学领域具有较高的声誉。对于有意向攻读医学相关专业的学生来说，了解该校研究生院的优势专业以及与交通大学（通常指上海交通大学医学院）的对比情况，是非常重要的。

首先，复旦大学上海医学院的研究生专业设置涵盖了基础医学、临床医学、公共卫生、药学、生物医学工程等多个方向。其中，基础医学、临床医学、公共卫生等专业是该校的传统优势学科，尤其在科研实力和师资力量方面表现突出。例如，基础医学在教育部第四轮学科评估中被评为A+，显示出其在国内的领先地位。

在临床医学方面，复旦大学上海医学院依托附属医院如华山医院、中山医院等，拥有丰富的临床资源和实践机会，为学生提供了良好的学习和发展平台。此外，公共卫生与预防医学也是该校的重点发展方向之一，特别是在应对突发公共卫生事件、流行病防控等方面积累了丰富经验。

相比之下，上海交通大学医学院同样在医学领域有着较强的竞争力。其在生物医学工程、药学、临床医学等方面也有着不俗的表现。尤其是近年来，随着上海交通大学整体实力的提升，其医学院也在不断加强科研投入和国际合作，逐渐缩小与复旦大学上海医学院的差距。

从学科建设来看，两校各有侧重。复旦大学上海医学院在基础医学和临床医学方面更具传统优势，而上海交通大学医学院则在生物医学工程、转化医学等领域发展迅速。此外，两校在国际化程度、科研平台建设以及毕业生就业去向等方面也存在一定差异。

总体而言，复旦大学上海医学院和上海交通大学医学院都是国内医学领域的佼佼者，选择哪一所院校更多取决于个人的兴趣方向、职业规划以及对学校资源的偏好。如果更倾向于基础医学和临床医学的研究与实践，复旦大学上海医学院可能是更好的选择；而如果对新兴交叉学科或工程与医学结合的方向感兴趣，上海交通大学医学院可能更具吸引力。

建议有意报考的学生在做出决定前，可以多参考两校的官网信息、学科排名、导师团队以及往届学生的反馈，综合评估后做出最适合自己的选择。